破常规实行年薪制
公立医院的改革重点，就是如何既要坚持公益性，又能调动医务人员的积极性。然后，通过内部管理，提升效率。
那么,药品加成取消后，又如何调动医务人员的积极性？三明市的做法是，在县级以上医院试行院长年薪制。
根据方案，院长的年薪由属地财政部门发放，全市22家二级以上公立医院院长的绩效考核权限上移，由三明市卫生局、财政局、人力资源和社会保障局和公务员局根据履职情况进行综合考核。
在具体操作上，首先对公立医院院长作细化的目标考核，考核项目包括服务评价、办院方向、平安建设、管理有效、发展持续等五大类共34个子类指标。五大类指标中，考核的重点是办院方向，考核指标包括均次费用、药占比、住院率、目录外药品比例、检查化验收入比等指标。
依照方案，医院院长的年薪根据上述考核结果来发放，院长年薪由基本年薪和年度绩效薪水构成。不同的考核结果，院长拿到的年薪总额就不一样。而且院长的考核结果还将影响医务人员工资总额的发放。因为，每年计算医生工资总额时，院长年度考核百分值是其中4个影响因素之一。
2014年初，三明市22家公立医院院长2013年度（即实行年薪制的首个年度）绩效考核结果出炉，相关结果公布在三明市卫生网站上，同时公布的还有相对应的院长年薪。结果显示，三明市第一医院院长黄跃获得最高分90.04分。经换算，黄跃2013年实际年薪收入为31.51万元。他的年薪比排名最后的院长多出15万元。
在实行院长年薪制后，医生年薪制也开始推出，其年薪结构主要包含基本年薪、绩效年薪两大部分：基本年薪按月发放；绩效年薪则与岗位工作量、医德医风、社会评议挂钩，通过医院和科室两级考核后确定实际薪酬。医生的年薪分初级、中级、副高和正高四级，分别对应10万元、15万元、20万元、25万元，而且每一级别内再设若干档次。
医生年薪制的目标是将医务人员的工资提升至社会平均工资的3至5倍左右。据统计数字显示，2013年，三明市城镇居民人均可支配收入约为2.6万元，为此三明市在医生年薪制设计过程中，分别按高于当地事业单位平均工资水平3倍以上，略高于教师平均工资水平或相当于事业单位平均工资水平的标准核定年薪。
三明市规定，在院长和医生的年薪制度下，院长的收入不再与所在医院的创收相关，而是与承担的风险、职责相匹配；各医院不得再以任何形式发放与职工个人有关的津补贴及奖金等，否则直接扣除院长年薪10%作为处罚。
