根据广州市新型冠状病毒肺炎疫情防控指挥部部署要求，自2021年5月31日22时起，通过广州辖区内机场、铁路、公路客运站等站场离穗的旅客（不含外地中转旅客），须凭“健康码”绿码，并持有72小时内核酸检测阴性证明。因未能及时出具核酸检测阴性证明无法按时出发的旅客可申请免费退改签。
6月1日上午，在广州南站一楼大厅，出行的旅客数量比以往有所减少。车站在实名制验证区域前设置了4个“健康码”及核酸检测证明查验点，安排有多名工作人员负责引导，并对进站旅客逐一测量体温。记者发现，不少旅客因未能出具72小时内核酸检测阴性证明，选择了改签或退票。
在广州白云机场，为了方便统一查验核酸检测报告，机场方面从5月31日起取消了自助托运行李服务，并在值机口和安检入口处设置了核酸检测证明查验点。工作人员会为持有“健康码”绿码及72小时内核酸阴性检测报告的旅客进行“双复核”，并派发绿色标签，旅客只有凭标签才能办理行李托运和值机。
公路方面，为确保货运车辆正常通行，广州市交通运输部门设立了10个干线货运司机核酸检测点，为货车司机提供免费的核酸检测服务。根据相关要求，货车司机需要凭有效车辆行驶证、从业资格证和驾驶证以及“健康码”绿码，方可进行核酸检测。
